[ Источник: zalign ]
Пакет: zalign (0.9.1-3)
Ссылки для zalign
Ресурсы Trisquel:
Исходный код zalign:
Сопровождающий:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)
- Steffen Moeller
- Andreas Tille
Внешние ресурсы:
- Сайт [launchpad.net]
Подобные пакеты:
parallel local alignment of biological sequences
zAlign is a local sequence aligner, especially intended for use with large biological DNA sequences, with more than 1Mbp (Millions of base pairs). It uses the Smith-Waterman exact algorithm with affine gap cost function to perform this task.
zAlign can be used both in distributed (clusters, for example) or standalone environments. Currently it has been tested on Linux and Sun Solaris, using both the MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) and OpenMPI (http://www.open-mpi.org/) implementations. Ports for other Unix-like environments are highly considered.
Другие пакеты, относящиеся к zalign
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.4)
- GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC support library
-
- dep: libopenmpi2
- high performance message passing library -- shared library
-
- dep: libstdc++6 (>= 4.9)
- GNU Standard C++ Library v3
Загрузка zalign
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| i386 | 48,6 Кб | 253 Кб | [список файлов] |