Пакет: murasaki (1.68.6-9build2)

Ссылки для murasaki

Ресурсы Trisquel:

Исходный код murasaki:

Сопровождающий:

Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)
Andreas Tille

Внешние ресурсы:

Сайт [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

Подобные пакеты:

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Другие пакеты, относящиеся к murasaki

зависимости

рекомендации

предложения

dep: libboost-filesystem1.71.0

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-iostreams1.71.0

Boost.Iostreams Library
dep: libboost-regex1.71.0-icu66

виртуальный пакет, предоставляемый libboost-regex1.71.0
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armhf]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 9) [amd64]
dep: murasaki-common

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Загрузка murasaki

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	529,3 Кб	3315 Кб	[список файлов]
armhf	407,7 Кб	1841 Кб	[список файлов]

Sections