Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Balíky >> aramo >> science >> seqmagick
nabia  ] [  aramo  ]
[ Zdroj: seqmagick  ]

Balík: seqmagick (0.8.4-3)

Odkazy pre seqmagick

seqmagick

Zdroje Trisquel:

Stiahnuť zdrojový balík seqmagick:

Správca:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (Konferencia)
  • Andreas Tille
  • Étienne Mollier

Externé zdroje:

Podobné balíky:

imagemagick-like frontend to Biopython SeqIO

Seqmagick is a little utility to expose the file format conversion in BioPython in a convenient way.

Features include:

 * Modifying sequences:
   - Remove gaps
   - Reverse & reverse complement
   - Trim to a range of residues
   - Change case
   - Sort by length or ID
 * Displaying information about sequence files
 * Subsetting sequence files by:
   - Position
   - ID
   - Deduplication
 * Filtering sequences by quality score
 * Trimming alignments to a region of interest defined by the forward
   and reverse primers

Ostatné balíky súvisiace s balíkom seqmagick

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
  • dep: python3-biopython
    Python3 library for bioinformatics
  • dep: python3-pygtrie
    Python library implementing a trie data structure (Python 3)

Stiahnuť seqmagick

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
all 40.4 kB223 kB [zoznam súborov]