Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Balíky >> ecne (12.0LTS) >> python >> python3-pyspoa
[  aramo  ] [  ecne  ] [  xolotl  ]
[ Zdroj: python-pyspoa  ]

Balík: python3-pyspoa (0.0.10-1build2)

Python bindings to spoa

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

This package presents Python bindings for the spoa library

Ostatné balíky súvisiace s balíkom python3-pyspoa

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • dep: libc6 (>= 2.32)
    GNU C Library: Shared libraries
    tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armhf, riscv64]
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5) [amd64]
    SIMD partial order alignment library
    dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8) [nie amd64]
  • dep: libstdc++6 (>= 13.1)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: python3 (<< 3.13)
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
    dep: python3 (>= 3.12~)

Stiahnuť python3-pyspoa

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
amd64 55.1 kB149 kB [zoznam súborov]
arm64 51.3 kB149 kB [zoznam súborov]
armhf 49.3 kB100 kB [zoznam súborov]
ppc64el 58.7 kB213 kB [zoznam súborov]
riscv64 56.1 kB125 kB [zoznam súborov]