Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Paket >> aramo >> python >> python3-pairtools
[  aramo  ]
[ Källkod: pairtools  ]

Paket: python3-pairtools (0.3.0-3.2build1)

Länkar för python3-pairtools

python3-pairtools

Trisquelresurser:

Hämta källkodspaketet pairtools:

Ansvarig:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (E-postarkiv)
  • Antoni Villalonga

Externa resurser:

Liknande paket:

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations: 

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

Andra paket besläktade med python3-pairtools

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • dep: cython3
    C-Extensions for Python 3
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
    dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
    dep: python3 (<< 3.11)
    dep: python3 (>= 3.10~)
  • dep: python3-click
    Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
  • dep: python3-nose
    test discovery and running for Python3 unittest
  • dep: python3-numpy (>= 1:1.20.0)
    Fast array facility to the Python 3 language
  • dep: python3-numpy-abi9
    virtuellt paket som tillhandahålls av python3-numpy

Hämta python3-pairtools

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Paketstorlek Installerad storlek Filer
amd64 130,0 kbyte441 kbyte [filförteckning]
arm64 123,5 kbyte404 kbyte [filförteckning]
armhf 118,4 kbyte338 kbyte [filförteckning]
ppc64el 146,8 kbyte540 kbyte [filförteckning]