Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Paket >> nabia >> science >> fml-asm
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Källkod: fermi-lite  ]

Paket: fml-asm (0.1-9ubuntu1)

Länkar för fml-asm

fml-asm

Trisquelresurser:

Hämta källkodspaketet fermi-lite:

Ansvarig:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (E-postarkiv)
  • Sascha Steinbiss

Externa resurser:

Liknande paket:

tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

Andra paket besläktade med fml-asm

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.7) [armhf]
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Hämta fml-asm

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Paketstorlek Installerad storlek Filer
amd64 66,3 kbyte158 kbyte [filförteckning]
armhf 65,3 kbyte113 kbyte [filförteckning]