Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Packages >> aramo >> ruby >> ruby-fix-trinity-output
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Source: ruby-fix-trinity-output  ]

Пакунок: ruby-fix-trinity-output (1.0.0-2)

Fix output fastq files from trinityrnaseq

trinityrnaseq outputs fastq files that have been 'corrected'

Unfortunately these files are no longer properly paired and therefore can't be used in most aligners such as bowtie2 and snap-aligner. This script attempts to fix that and produce 2 properly paired fastq files and a fastq file containing single reads

Інші пакунки пов'язані з ruby-fix-trinity-output

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: ruby
    Interpreter of object-oriented scripting language Ruby (default version)
    or ruby-interpreter
    Пакунок недоступний
  • dep: ruby-trollop (>= 2.0)
    command-line argument processing library

Завантажити ruby-fix-trinity-output

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
all 5.0 kB30 kB [список файлів]