Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Packages >> ecne (12.0LTS) >> python >> python3-pyspoa
[  aramo  ] [  ecne  ] [  xolotl  ]
[ Source: python-pyspoa  ]

Пакунок: python3-pyspoa (0.0.10-1build2)

Python bindings to spoa

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

This package presents Python bindings for the spoa library

Інші пакунки пов'язані з python3-pyspoa

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc6 (>= 2.32)
    GNU C Library: Shared libraries
    also a virtual package provided by libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [not armhf, riscv64]
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5) [amd64]
    SIMD partial order alignment library
    dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8) [not amd64]
  • dep: libstdc++6 (>= 13.1)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: python3 (<< 3.13)
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
    dep: python3 (>= 3.12~)

Завантажити python3-pyspoa

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
amd64 55.1 kB149 kB [список файлів]
arm64 51.3 kB149 kB [список файлів]
armhf 49.3 kB100 kB [список файлів]
ppc64el 58.7 kB213 kB [список файлів]
riscv64 56.1 kB125 kB [список файлів]