[ Източник: mash ]
Пакет: mash (2.3+dfsg-1build2)
Връзки за mash
Ресурси за Trisquel:
Изтегляне на пакет-източник mash.
Отговорник:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)
- Sascha Steinbiss
Външни препратки:
- Начална страница [mash.readthedocs.io]
Подобни пакети:
fast genome and metagenome distance estimation using MinHash
Mash uses MinHash locality-sensitive hashing to reduce large biosequences to a representative sketch and rapidly estimate pairwise distances between genomes or metagenomes. Mash sketch databases effectively delineate known species boundaries, allow construction of approximate phylogenies, and can be searched in seconds using assembled genomes or raw sequencing runs from Illumina, Pacific Biosciences, and Oxford Nanopore. For metagenomics, Mash scales to thousands of samples and can replicate Human Microbiome Project and Global Ocean Survey results in a fraction of the time.
Други пакети, свързани с mash
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libcapnp-0.8.0
- Cap'n Proto C++ library
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)
- GCC support library
-
- dep: libgsl27 (>= 2.7.1)
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
-
- dep: libmurmurhash2 (>= 0.2)
- Portable MurmurHash Implementation
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
Изтегляне на mash
| Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|
| arm64 | 143,1 кБ | 329 кБ | [списък на файловете] |