Пакет: bio-vcf (0.9.5-3)

Връзки за bio-vcf

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник bio-vcf.

Отговорник:

Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)
Andreas Tille
Nilesh Patra

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

domain specific language (DSL) for processing the VCF format

Bio-vcf provides a domain specific language (DSL) for processing the VCF format. Record named fields can be queried with regular expressions, e.g.

 sample.dp>20 and rec.filter !~ /LowQD/ and rec.tumor.bcount[rec.alt]>4

Bio-vcf is a new generation VCF parser, filter and converter. Bio-vcf is not only very fast for genome-wide (WGS) data, it also comes with a really nice filtering, evaluation and rewrite language and it can output any type of textual data, including VCF header and contents in RDF and JSON.

Други пакети, свързани с bio-vcf

зависимости

препоръчани

предложени

dep: ruby

Interpreter of object-oriented scripting language Ruby (default version)

Изтегляне на bio-vcf

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
all	29,2 кБ	141 кБ	[списък на файловете]

Sections