Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Paketit >> aramo >> science >> ntcard
aramo  ]
[ Source: ntcard  ]

Paketti: ntcard (1.2.2+dfsg-3)

Streaming algorithm to estimate cardinality in genomics datasets

As input it takes file(s) in fasta, fastq, sam, or bam formats and computes the total number of distinct k-mers, F0, and also the k-mer coverage frequency histogram, fi, i>=1.

Muut pakettiin ntcard liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)
    GCC support library
  • dep: libgomp1 (>= 6)
    GCC OpenMP (GOMP) support library
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3

Imuroi ntcard

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
amd64 36.3 kt165 kt [tiedostoluettelo]