Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Balíky >> aramo >> science >> ntcard
aramo  ]
[ Zdroj: ntcard  ]

Balík: ntcard (1.2.2+dfsg-3)

Streaming algorithm to estimate cardinality in genomics datasets

As input it takes file(s) in fasta, fastq, sam, or bam formats and computes the total number of distinct k-mers, F0, and also the k-mer coverage frequency histogram, fi, i>=1.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ntcard

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)
    GCC support library
  • dep: libgomp1 (>= 6)
    GCC OpenMP (GOMP) support library
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3

Stiahnuť ntcard

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
amd64 36.3 kB165 kB [zoznam súborov]