Skip to content
Sections
>> Trisquel >> パッケージ >> etiona >> science >> srst2
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ ソース: srst2  ]

パッケージ: srst2 (0.2.0-5)

srst2 に関するリンク

srst2

Trisquel の資源:

srst2 ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

Original Maintainers:

外部の資源:

類似のパッケージ:

Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens

This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.

その他の srst2 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: bowtie2
    ultrafast memory-efficient short read aligner
  • dep: cd-hit
    suite of programs designed to quickly group sequences
  • dep: python
    interactive high-level object-oriented language (default version)
  • dep: python-biopython
    Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)
  • dep: python-scipy
    scientific tools for Python
  • dep: samtools
    processing sequence alignments in SAM and BAM formats
  • rec: python-rpy2
    Python 2 interface to the GNU R language and environment (version 2.8)

srst2 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 59.1 kB258 kB [ファイル一覧]