Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> seqmagick
nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: seqmagick  ]

Pakiet: seqmagick (0.8.4-3)

Odnośniki dla seqmagick

seqmagick

Zasoby systemu Trisquel:

Pobieranie pakietu źródłowego seqmagick:

Opiekun:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)
  • Andreas Tille
  • Étienne Mollier

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

imagemagick-like frontend to Biopython SeqIO

Seqmagick is a little utility to expose the file format conversion in BioPython in a convenient way.

Features include:

 * Modifying sequences:
   - Remove gaps
   - Reverse & reverse complement
   - Trim to a range of residues
   - Change case
   - Sort by length or ID
 * Displaying information about sequence files
 * Subsetting sequence files by:
   - Position
   - ID
   - Deduplication
 * Filtering sequences by quality score
 * Trimming alignments to a region of interest defined by the forward
   and reverse primers

Inne pakiety związane z seqmagick

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
  • dep: python3-biopython
    Python3 library for bioinformatics
  • dep: python3-pygtrie
    Python library implementing a trie data structure (Python 3)

Pobieranie seqmagick

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
all 40,4 KiB223 KiB [lista plików]