Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> sprai
etiona  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: sprai  ]

Pakiet: sprai (0.9.9.23+dfsg1-2)

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Inne pakiety związane z sprai

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.17)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: ncbi-blast+
    next generation suite of BLAST sequence search tools
  • dep: perl
    Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
  • dep: time
    GNU time program for measuring CPU resource usage
  • sug: make
    utility for directing compilation
  • sug: pbalign
    Pakiet niedostępny
  • sug: pbgenomicconsensus
    Pakiet niedostępny
  • sug: pbh5tools
    Pakiet niedostępny

Pobieranie sprai

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
arm64 1 472,5 KiB1694 KiB [lista plików]