Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> velvet
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: velvet  ]

Pakiet: velvet (1.2.10+dfsg1-7)

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Inne pakiety związane z velvet

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: libgomp1 (>= 4.9)
    GCC OpenMP (GOMP) support library
  • dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)
    compression library - runtime

Pobieranie velvet

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
arm64 635,4 KiB1209 KiB [lista plików]