Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> nast-ier
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: microbiomeutil  ]

Pakiet: nast-ier (20101212+dfsg1-5)

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Inne pakiety związane z nast-ier

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: cdbfasta
    Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: microbiomeutil-data
    Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools
  • rec: ncbi-blast+
    next generation suite of BLAST sequence search tools

Pobieranie nast-ier

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 21,0 KiB101 KiB [lista plików]
arm64 20,8 KiB96 KiB [lista plików]
armhf 20,9 KiB92 KiB [lista plików]
ppc64el 21,6 KiB149 KiB [lista plików]