Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Balíky >> aramo >> science >> nast-ier
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Zdroj: microbiomeutil  ]

Balík: nast-ier (20101212+dfsg1-5)

NAST-based DNA alignment tool

The NAST-iEr alignment utility aligns a single raw nucleotide sequence against one or more NAST formatted sequences.

The alignment algorithm involves global dynamic programming profile alignment to fixed (NAST-formatted) multiply aligned template sequences without any end-gap penalty.

NAST-iEr is part of the microbiomeutil suite.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom nast-ier

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • dep: cdbfasta
    Constant DataBase indexing and retrieval tools for multi-FASTA files
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
  • dep: microbiomeutil-data
    Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools
  • rec: ncbi-blast+
    next generation suite of BLAST sequence search tools

Stiahnuť nast-ier

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
amd64 21.0 kB101 kB [zoznam súborov]
arm64 20.8 kB96 kB [zoznam súborov]
armhf 20.9 kB92 kB [zoznam súborov]
ppc64el 21.6 kB149 kB [zoznam súborov]