Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> umis-examples
aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: umis  ]

Pakiet: umis-examples (1.0.8-1build1)

tools for processing UMI RNA-tag data (examples)

Umis provides tools for estimating expression in RNA-Seq data which performs sequencing of end tags of transcript, and incorporate molecular tags to correct for amplification bias.

There are four steps in this process.

 1. Formatting reads
 2. Filtering noisy cellular barcodes
 3. Pseudo-mapping to cDNAs
 4. Counting molecular identifiers

Example and test files for umis.

Inne pakiety związane z umis-examples

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • rec: umis
    tools for processing UMI RNA-tag data

Pobieranie umis-examples

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
all 170,6 KiB395 KiB [lista plików]