Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Balíky >> aramo >> science >> umis-examples
aramo  ]
[ Zdroj: umis  ]

Balík: umis-examples (1.0.8-1build1)

tools for processing UMI RNA-tag data (examples)

Umis provides tools for estimating expression in RNA-Seq data which performs sequencing of end tags of transcript, and incorporate molecular tags to correct for amplification bias.

There are four steps in this process.

 1. Formatting reads
 2. Filtering noisy cellular barcodes
 3. Pseudo-mapping to cDNAs
 4. Counting molecular identifiers

Example and test files for umis.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom umis-examples

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • rec: umis
    tools for processing UMI RNA-tag data

Stiahnuť umis-examples

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
all 170.6 kB395 kB [zoznam súborov]