Пакет: pbalign (0.3.0-1)
Ссылки для pbalign
Ресурсы Trisquel:
Исходный код pbalign:
Сопровождающий:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)
- Afif Elghraoui
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences
pbalign aligns PacBio reads to reference sequences, filters aligned reads according to user-specific filtering criteria, and converts the output to either the SAM format or PacBio Compare HDF5 (e.g., .cmp.h5) format.
This package is part of the SMRTAnalysis suite.
Другие пакеты, относящиеся к pbalign
|
|
|
-
- dep: blasr (>= 5.3+0)
- mapping single-molecule sequencing reads
-
- dep: python
- interactive high-level object-oriented language (default version)
-
- dep: python-pbalign
- map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences (Python2)
-
- dep: python-pkg-resources
- Package Discovery and Resource Access using pkg_resources
-
- rec: hdf5-tools
- Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - Runtime tools
-
- rec: python-pbh5tools
- tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files -- Python 2 library
-
- sug: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- sug: gmap
- Пакет недоступен
-
- sug: pbalign-doc
- documentation for pbalign
Загрузка pbalign
Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|
all | 6,9 Кб | 33 Кб | [список файлов] |