Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Paket >> aramo >> gnu-r >> r-cran-sctransform
nabia  ] [  aramo  ]
[ Källkod: r-cran-sctransform  ]

Paket: r-cran-sctransform (0.3.3-1)

Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI Data

A normalization method for single-cell UMI count data using a variance stabilizing transformation. The transformation is based on a negative binomial regression model with regularized parameters. As part of the same regression framework, this package also provides functions for batch correction, and data correction. See Hafemeister and Satija 2019 <doi:10.1101/576827> for more details.

Andra paket besläktade med r-cran-sctransform

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • sug: r-cran-irlba
    GNU R fast truncated SVD, PCA and symmetric eigendecomposition
  • sug: r-cran-knitr
    GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

Hämta r-cran-sctransform

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Paketstorlek Installerad storlek Filer
amd64 487,4 kbyte730 kbyte [filförteckning]
arm64 478,6 kbyte702 kbyte [filförteckning]
armhf 478,0 kbyte649 kbyte [filförteckning]
ppc64el 492,3 kbyte818 kbyte [filförteckning]