[ nabia ]
[ aramo ]
[ Източник: stringtie ]
Пакет: stringtie (2.1.1+ds-2)
Връзки за stringtie
Ресурси за Trisquel:
Изтегляне на пакет-източник stringtie.
Отговорник:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)
- Steffen Moeller
Външни препратки:
- Начална страница [ccb.jhu.edu]
Подобни пакети:
assemble short RNAseq reads to transcripts
The abundance of transcripts in a human tissue sample can be determined by RNA sequencing. The exact sequence sampled may be random, depending on the technology used. And it may be short, i.e. shorter than the transcript. At some point, many shorter reads need to be assembled to the model the complete transcripts.
StringTie knows how to assemble of RNA-Seq into potential transcripts without the need of a reference genome and provides a quantification also of the splice variants.
Други пакети, свързани с stringtie
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.7) [armhf]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- compression library - runtime
Изтегляне на stringtie
| Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|
| amd64 | 396,2 кБ | 1047 кБ | [списък на файловете] |
| armhf | 344,8 кБ | 674 кБ | [списък на файловете] |