Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Paquets >> aramo >> science >> kleborate-examples
nabia  ] [  aramo  ]
[ Paquet source : kleborate  ]

Paquet : kleborate-examples (2.2.0-1)

Liens pour kleborate-examples

kleborate-examples

Ressources Trisquel :

Télécharger le paquet source kleborate :

Responsable :

Original Maintainers:

Ressources externes :

Paquets similaires :

tool to screen Klebsiella genome assemblies (example data)

Kleborate is a tool to screen Klebsiella genome assemblies for:

 * MLST sequence type
 * species (e.g. K. pneumoniae, K. quasipneumoniae, K. variicola, etc.)
 * ICEKp associated virulence loci: yersiniabactin (ybt),
   colibactin (clb)
 * virulence plasmid associated loci: salmochelin (iro), aerobactin
   (iuc), hypermucoidy (rmpA, rmpA2)
 * antimicrobial resistance genes, including quinolone resistance SNPs
   and colistin resistance truncations
 * K (capsule) and O antigen (LPS) serotype prediction, via wzi alleles
   and Kaptive

This package provides example data end tests that are used in autopkgtest.

Autres paquets associés à kleborate-examples

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • rec: kleborate
    tool to screen Klebsiella genome assemblies

Télécharger kleborate-examples

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
all 5 848,7 ko5862 ko [liste des fichiers]