Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Balíky >> aramo >> science >> kleborate-examples
[  nabia  ] [  aramo  ]
[ Zdroj: kleborate  ]

Balík: kleborate-examples (2.2.0-1)

Odkazy pre kleborate-examples

kleborate-examples

Zdroje Trisquel:

Stiahnuť zdrojový balík kleborate:

Správca:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (Konferencia)
  • Andreas Tille
  • Étienne Mollier

Externé zdroje:

Podobné balíky:

tool to screen Klebsiella genome assemblies (example data)

Kleborate is a tool to screen Klebsiella genome assemblies for: 

 * MLST sequence type
 * species (e.g. K. pneumoniae, K. quasipneumoniae, K. variicola, etc.)
 * ICEKp associated virulence loci: yersiniabactin (ybt),
   colibactin (clb)
 * virulence plasmid associated loci: salmochelin (iro), aerobactin
   (iuc), hypermucoidy (rmpA, rmpA2)
 * antimicrobial resistance genes, including quinolone resistance SNPs
   and colistin resistance truncations
 * K (capsule) and O antigen (LPS) serotype prediction, via wzi alleles
   and Kaptive

This package provides example data end tests that are used in autopkgtest.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom kleborate-examples

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • rec: kleborate
    tool to screen Klebsiella genome assemblies

Stiahnuť kleborate-examples

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
all 5,848.7 kB5862 kB [zoznam súborov]