Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Paket >> aramo >> science >> kleborate-examples
nabia  ] [  aramo  ]
[ Källkod: kleborate  ]

Paket: kleborate-examples (2.2.0-1)

Länkar för kleborate-examples

kleborate-examples

Trisquelresurser:

Hämta källkodspaketet kleborate:

Ansvarig:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (E-postarkiv)
  • Andreas Tille
  • Étienne Mollier

Externa resurser:

Liknande paket:

tool to screen Klebsiella genome assemblies (example data)

Kleborate is a tool to screen Klebsiella genome assemblies for:

 * MLST sequence type
 * species (e.g. K. pneumoniae, K. quasipneumoniae, K. variicola, etc.)
 * ICEKp associated virulence loci: yersiniabactin (ybt),
   colibactin (clb)
 * virulence plasmid associated loci: salmochelin (iro), aerobactin
   (iuc), hypermucoidy (rmpA, rmpA2)
 * antimicrobial resistance genes, including quinolone resistance SNPs
   and colistin resistance truncations
 * K (capsule) and O antigen (LPS) serotype prediction, via wzi alleles
   and Kaptive

This package provides example data end tests that are used in autopkgtest.

Andra paket besläktade med kleborate-examples

  • beror
  • rekommenderar
  • föreslår
  • rec: kleborate
    tool to screen Klebsiella genome assemblies

Hämta kleborate-examples

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur Paketstorlek Installerad storlek Filer
all 5.848,7 kbyte5862 kbyte [filförteckning]