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[ ソース: bedtools  ]

パッケージ: bedtools (2.26.0+dfsg-5)

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

その他の bedtools 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.23)
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64]
    GCC support library
    dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
    compression library - runtime

bedtools のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 563.2 kB1992 kB [ファイル一覧]
i386 615.6 kB2203 kB [ファイル一覧]