Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> etiona >> science >> bedtools
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ] [  aramo-updates  ]
[ Pakiet źródłowy: bedtools  ]

Pakiet: bedtools (2.26.0+dfsg-5)

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Inne pakiety związane z bedtools

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.23)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64]
    GCC support library
    dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
    compression library - runtime

Pobieranie bedtools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 563,2 KiB1992 KiB [lista plików]
i386 615,6 KiB2203 KiB [lista plików]