Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакеты >> etiona >> science >> bedtools
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ] [  aramo-updates  ]
[ Источник: bedtools  ]

Пакет: bedtools (2.26.0+dfsg-5)

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Другие пакеты, относящиеся к bedtools

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • dep: libc6 (>= 2.23)
    GNU C Library: Shared libraries
    также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64]
    GCC support library
    dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
    compression library - runtime

Загрузка bedtools

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
amd64 563,2 Кб1992 Кб [список файлов]
i386 615,6 Кб2203 Кб [список файлов]