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[ Paquet source : ggd-utils  ]

Paquet : ggd-utils (1.0.0+ds-1)

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that: 

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Autres paquets associés à ggd-utils

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

Télécharger ggd-utils

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 1 809,6 ko4933 ko [liste des fichiers]
arm64 1 633,2 ko4765 ko [liste des fichiers]
armhf 1 594,1 ko4335 ko [liste des fichiers]
ppc64el 1 519,1 ko4775 ko [liste des fichiers]