Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> aramo >> science >> ggd-utils
aramo  ]
[ Източник: ggd-utils  ]

Пакет: ggd-utils (1.0.0+ds-1)

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Други пакети, свързани с ggd-utils

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

Изтегляне на ggd-utils

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 1 809,6 кБ4933 кБ [списък на файловете]
arm64 1 633,2 кБ4765 кБ [списък на файловете]
armhf 1 594,1 кБ4335 кБ [списък на файловете]
ppc64el 1 519,1 кБ4775 кБ [списък на файловете]