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[ ソース: unikmer  ]

パッケージ: unikmer (0.18.8-1)

Toolkit for nucleic acid k-mer analysis

unikmer is a golang package and a toolkit for nucleic acid k-mer analysis, providing functions including set operation k-mers optional with TaxIDs but without count information.

K-mers are either encoded (k<=32) or hashed (arbitrary k) into uint64, and serialized in binary file with extension .unik.

TaxIDs can be assigned when counting k-mers from genome sequences, and LCA (Lowest Common Ancestor) is computed during set opertions including computing union, intersecton, set difference, unique and repeated k-mers.

その他の unikmer 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

unikmer のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 2,447.7 kB7150 kB [ファイル一覧]
arm64 2,189.5 kB6910 kB [ファイル一覧]
armhf 2,169.1 kB6297 kB [ファイル一覧]
ppc64el 2,054.4 kB6951 kB [ファイル一覧]