Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> aramo >> science >> unikmer
aramo  ]
[ Източник: unikmer  ]

Пакет: unikmer (0.18.8-1)

Toolkit for nucleic acid k-mer analysis

unikmer is a golang package and a toolkit for nucleic acid k-mer analysis, providing functions including set operation k-mers optional with TaxIDs but without count information.

K-mers are either encoded (k<=32) or hashed (arbitrary k) into uint64, and serialized in binary file with extension .unik.

TaxIDs can be assigned when counting k-mers from genome sequences, and LCA (Lowest Common Ancestor) is computed during set opertions including computing union, intersecton, set difference, unique and repeated k-mers.

Други пакети, свързани с unikmer

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

Изтегляне на unikmer

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 2 447,7 кБ7150 кБ [списък на файловете]
arm64 2 189,5 кБ6910 кБ [списък на файловете]
armhf 2 169,1 кБ6297 кБ [списък на файловете]
ppc64el 2 054,4 кБ6951 кБ [списък на файловете]