Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Balíky >> aramo >> science >> unikmer
aramo  ]
[ Zdroj: unikmer  ]

Balík: unikmer (0.18.8-1)

Toolkit for nucleic acid k-mer analysis

unikmer is a golang package and a toolkit for nucleic acid k-mer analysis, providing functions including set operation k-mers optional with TaxIDs but without count information.

K-mers are either encoded (k<=32) or hashed (arbitrary k) into uint64, and serialized in binary file with extension .unik.

TaxIDs can be assigned when counting k-mers from genome sequences, and LCA (Lowest Common Ancestor) is computed during set opertions including computing union, intersecton, set difference, unique and repeated k-mers.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom unikmer

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

Stiahnuť unikmer

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
amd64 2,447.7 kB7150 kB [zoznam súborov]
arm64 2,189.5 kB6910 kB [zoznam súborov]
armhf 2,169.1 kB6297 kB [zoznam súborov]
ppc64el 2,054.4 kB6951 kB [zoznam súborov]