[ nabia ]
[ aramo ]
[ Источник: cyvcf2 ]
Пакет: python3-cyvcf2 (0.30.14-1build1)
Ссылки для python3-cyvcf2
Ресурсы Trisquel:
Исходный код cyvcf2:
Сопровождающий:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Почтовый архив)
- Steffen Moeller
- Liubov Chuprikova
- Nilesh Patra
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
VCF parser based on htslib (Python 3)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 3.
Другие пакеты, относящиеся к python3-cyvcf2
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C Library: Shared libraries
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.7) [armhf]
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.11)
- dep: python3 (>= 3.10~)
-
- dep: python3-click
- Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
-
- dep: python3-coloredlogs
- colored terminal output for Python 3's logging module
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.20.0)
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-numpy-abi9
- виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy
Загрузка python3-cyvcf2
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| amd64 | 817,0 Кб | 4733 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 806,8 Кб | 4671 Кб | [список файлов] |
| armhf | 794,9 Кб | 4455 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 874,8 Кб | 5036 Кб | [список файлов] |